.农产品初加工销售：如果农产品进行了初加工，如清洗、筛选、分级等，销售时可以抵扣相关的增值税。这种情况下，进项是指农产品加工过程中涉及到的物料、设备、服务等的增值税或者其他税费。农产品终端销售：农产品进入市场后，如果终端销售给消费者，销售者可以抵扣相关的增值税。
正面回答农产品加工企业购进农产品的增值税抵扣政策。农产品加工企业在购进农业生产者销售的自产农产品时_可以按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算进项税额。
农产品加工企业购进农产品，可凭增值税发票、海关进出口增值税专用缴款书、农产品收购发票或销售发票抵扣进项税额。下一步，将继续支持地方扩大农产品加工企业进项税额核定扣除试点行业范围，完善农产品初加工所得税优惠目录，落实税收优惠政策。
购进农产品，按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》抵扣进项税额的除外。最新税率是按9%计算抵扣。
购进免税农产品抵扣进项税的方式主要是根据税法规定，通过合法的发票和凭证，将购进免税农产品的金额从应纳税额中予以扣除。免税农产品的认定 免税农产品是指按照国家规定，在生产和销售环节免征增值税的农产品。这些农产品通常包括种植业、养殖业和林业等生产领域的部分产品。
购进农产品进项税的扣除规定是： 一般纳税人开具的增值税专用发票，购进企业可以按规定进行抵扣，即可以按照票面注明的税额抵扣； 海关进口增值税专用缴款书。
另外，税法还规定了其他可以用于抵扣进项税额的凭证，比如货物运输业统一发票（或部分实施“营改增”地区的运输业增值税发票）。这些凭证同样需要符合国家税务总局的规定，确保其真实性和合法性。企业在购进农产品时，应当妥善保管相关发票和凭证，以备税务检查之用。
法律分析：可以。购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。法律依据：《中华人民共和国会计法》 第十四条 会计凭证包括原始凭证和记帐凭证。
收购农产品取得普通发票可以抵扣。公司纳税人，在购进农产品时收到了流通环节小规模纳税人开具的增值税普通发票，抵扣进项税额。
抵扣方式：农产品收购发票是计算抵扣，不是认证或者勾选抵扣。农业生产者销售自产农产品适用免征增值税政策而开具的普通发票，即农产品销售发票。一般是买价×9％＝进项税额。
一般纳税人从农产品生产者购进农产品取得免税的增值税普通发票，可以计算抵扣进项税额。购进农产品直接销售，或者加工后仍然属于农产品的，对于购进的农产品按照9%扣除率计算抵扣；购进农产品用于加工13%税率产品的，加计扣除2%，即按照11%扣除率计算扣除。
一般来说，能抵扣税款的是所谓的增值税专用发票。但是以下几种普票也是可以抵扣税款的。一是农产品收购发票。农产品收购发票是指收购单位向农业生产者个人（不包括从事农产品收购的个体经营者）收购自产免税农业产品时，由付款方向收款方开具的发票。
取得的农产品普通发票可以抵扣。《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条纳税人购进货物或者接受应税劳务（以下简称购进货物或者应税劳务）支付或者负担的增值税额，为进项税额。下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。